Senteret er hovedsaklig opptatt med eksponerings- og effekstudier, kost-nytte-analyser og sosio-økonomiske studier av virkninger av forurensning i miljøet. Det legges spesiell vekt på prosjekter som fokuserer på Europas kystsoner. Senteret ble etablert i 1999.

Til CEE ligger også NILUs helseffektlaboratorium som ble åpnet i 2010. Laboratoriet undersøker giftigheten til ulike stoffer fra miljø eller produksjon (f.eks nanopartikler).